En la actualidad, casi el 80% de los supercomputadores corren GNU/Linux, mientras que un 12% apuestan por Unix. Lejos, muy lejos, quedan BSD, con un 0,8%, Mac OS X con un 0,6%, y Windows con un 0,4%. Aquí hay una tabla que muestra las cifras exactas que mueven cada uno de estos sistemas operativos:

Sistema Operativo	Equipos	Porcentaje
GNU/Linux	389	77,8%
Windows	2	0,4%
Unix	60	12%
Mac OS	3	0,6%
BSD	4	0,8%
Varios	42	8,4%